財團法人國家實驗研究院（National Institutes of Applied Research, NIAR），自2003年6月起，由原隸屬於行政院國家科學委員會（2014年3月改制科技部，2022年7月再改制行政院國家科學及技術委員會）之國家實驗室改制而成，並由院本部統合協調各單位之運作，以提升彈性與效率，協力達成「建構研發平台、支援學術研究、推動前瞻科技、培育科技人才」之重點任務，以促成國家科技發展體系垂直整合，並以打造成為世界級的國家實驗室為目標。

國研院之主管機關為國家科學及技術委員會（國科會），並設有董、監事會；全院現設有７國家實驗研究中心及1個籌備處，分別為國家生物模式中心、國家地震工程研究中心、國家高速網路與計算中心、台灣半導體研究中心、國家儀器科技研究中心、科技政策研究與資訊中心、台灣海洋科技研究中心，以及智慧機器人研究中心籌備處。